Vượt qua các khó khăn, Đoàn Bay vẫn hoàn thành xuất sắc các nhiệm vụ được giao, bên cạnh các nhiệm vụ mới như các chuyến bay giải tỏa đưa lao động Việt Nam tại Lybia về nước. Để giải cứu nhanh nhất lao động Việt Nam tại Libya, Vietnam Airlines đã lên kế hoạch thực hiện các chuyến bay đến thành phố Djerba (Tunisia), cách biên giới Libya khoảng 100km, để đón người lao động Việt Nam đã sơ tán từ Libya sang đây về nước. Chuyến bay đầu tiên giải cứu lao động Libya do đích thân Phó Tổng giám đốc Vietnam Airlines Phan Xuân Đức trực tiếp làm cơ trưởng. Trong một tuần thực hiện chiến dịch, đội bay B777 của Đoàn Bay đã đưa được hơn 3.000 người lao động về nước an toàn.

Chủ động triển khai công tác huấn luyện, trong năm 2011, Đoàn Bay đã huấn luyện định kỳ SIM cho 719 tổ bay, huấn luyện chuyển loại cho 63 phi công, huấn luyện nâng cấp lái chính cho 48 phi công, huấn luyện giáo viên TRI cho 22 phi công, huấn luyện giáo viên TRE cho 12 phi công, huấn luyện SFI cho 7 phi công và huấn luyện chuyển nhà khai thác cho 7 phi công.

Năm 2012, đồng chí Hoàng Văn Mạnh được điều chuyển lên công tác tại Tổng công ty Hàng không Việt Nam, đồng chí Nguyễn Hồng Lĩnh được bổ nhiệm làm Đoàn trưởng Đoàn Bay.

Bằng việc huấn luyện chuyển loại cho phi công nước ngoài, Đoàn Bay đã góp phần làm giảm chi phí thuê phi công với số tiền tiết kiệm được lên tới 84 tỷ đồng.

Tháng 8/2013, Tổng công ty Hàng không Việt Nam đã có quyết định về việc tổ chức lại Đoàn Bay 919, một số phòng vụ được đổi tên và sắp xếp lại công việc.

Nhân lực và phương tiện đưa đón phi công từ Đoàn Bay được điều chuyển sang NIAGS, TIAGS, trừ bộ phận lái xe và số xe để lại Đoàn Bay để phục vụ công tác hành chính. Nhiệm vụ thuê khách sạn cho phi công nước ngoài khi làm nhiệm vụ cũng được chuyển về cho các Chi nhánh khu vực miền Bắc và miền Nam. Nhiệm vụ đầu tư có xây dựng và sửa chữa lớn cơ sở vật chất của Đoàn Bay được điều chuyển về cho các cơ quan Tổng công ty.

Trong năm 2013, Đoàn Bay đã thực hiện được 113.848 chuyến bay với 255.570 giờ bay, trong đó có 217 chuyến chuyên cơ. Công tác khai thác bay của Đoàn bay có bước tiến mới trong việc sắp xếp lịch bay, tính ổn định, hợp lý về trình độ của từng tổ bay, đáp ứng tốt chủ trương điều hành linh hoạt, giảm tối đa tình trạng hủy chuyến do thiếu phi công hoặc nối chuyến không hợp lý. Công tác an toàn năm 2013 cũng có kết quả tốt hơn nhiều so với năm 2012, các vi phạm, sự cố uy hiếp an toàn bay giảm rõ rệt.

Về kết quả công tác huấn luyện đào tạo, trong năm 2013, Đoàn Bay đã huấn luyện chuyển loại cho 44 phi công, nâng cấp lái chính cho 16 phi công, huấn luyện giáo viên cho 23 phi công; riêng huấn luyện chuyển loại lái phụ cho phi công cơ bản đã đưa vào khai thác được 54 phi công. Đoàn đã huấn luyện định kỳ cho 1.362 phi công, trong đó đạt 1.359 phi công. Đoàn cũng tổ chức huấn luyện chuyển loại lái chính cho 18 phi công, đạt 16 phi công; huấn luyện chuyển loại 120 phi công, đạt 113 phi công.

Mùa hè năm 2014, tình hình Biển Đông có diễn biến phức tạp khi Trung Quốc kéo dàn khoan HD981 xâm phạm vùng đặc quyền kinh tế và thềm lục địa của Việt Nam, Đoàn Bay đã thường xuyên cập nhật thông tin kịp thời đến các phi công của các đội bay có các chuyến bay qua các vùng lãnh thổ Trung Quốc.

Giữa năm 2014, Hội đồng thành viên Tổng công ty Hàng không Việt Nam đã có nghị quyết về việc cải cách lại phương thức trả lương đối với phi công, theo đó, tăng 200% mức tiền lương đánh giá hiệu quả công việc, tăng mức tiền lương chức danh mới, đưa chế độ phụ cấp giờ giảng và phụ cấp giáo viên thiết lập hình thành mức lương chức danh đối với giáo viên là phi công. Thời gian áp dụng chính sách lương mới này là từ ngày 1/9/2014.

Trong năm 2014, Đoàn Bay gặp khó khăn về nguồn lực khi một số phi công Việt Nam xin chấm dứt hợp đồng để chuyển sang bay cho các hãng hàng không khác, trong đó số phi công nước ngoài xin chấm dứt hợp đồng trước thời hạn là 44 người. Để giải quyết vấn đề nguồn lực, ngoài việc tăng cường công tác tuyên truyền giáo dục và các hoạt động gắn kết đội ngũ phi công, Đoàn Bay đã chủ động đẩy nhanh huấn luyện chuyển loại giữa phi công cơ bản và huấn luyện nâng cấp lên lái chính nhằm cân đối lực lượng phi công giữa các đội bay, đáp ứng nhu cầu kế hoạch khai thác của Tổng công ty. Kết quả công tác đào tạo, Đoàn Bay đã huấn luyện 52 phi công cơ bản, chuyển loại cho các loại máy bay được 66 phi công, nâng cấp lái chính 41 phi công và huấn luyện giáo viên cho 43 phi công. Đồng thời, Đoàn bay cũng đã tuyển dụng được 57 phi công nước ngoài để bù đắp vào phần nhân sự thiếu hụt.

Trong các giai đoạn khó khăn về nguồn lực như vậy hoặc vào các thời gian cao điểm hằng năm, hoặc lúc phát sinh nhu cầu đột xuất của khách hàng về chuyến bay thuê chuyến, bộ phận Điều độ đã thể hiện sự nỗ lực trong công việc khi luôn giúp Đoàn Bay và Tổng công ty đảm bảo nguồn lực phục vụ khai thác.